下列因素会使角膜移植术后发生排斥反应的可能增大：
①患者角膜基质层存在新生血管，因为新生血管使免疫细胞更容易到达移植片，识别并攻击异体抗原。
②大的移植片因为携带的有效抗原强，并且靠近患者角膜缘，所以易发生排斥反应。
③患者自身敏感性较高，也易发生排斥反应。
④其他一些因素如炎症、眼部充血以及移植术后的其他手术操作也可能诱发排斥反应。
具体地说，有严重新生血管的角膜病变(如角膜白斑、酸碱烧伤)、角膜炎症未控制时、单纯疱疹性角膜炎、次角膜移植发生排斥反应需进行第二次角膜移植的患者，都比较容易发生角膜移植术后的排斥反应。